本作は哲学を主題としながらも小難しい用語はほとんど出てこない、ちょっとばかり特殊な主義を持つ男子高校生たちの活動を描いた物語である。
　高校生になったばかりの主人公・鹿内光流（かないひかる）は、他者との競争を嫌う内気な性格であるため、周囲からはつまらない奴と思われ、親しい友人のいない寂しい人生を送ってきた。そんな彼を勧誘したのが男子哲学部である。