現実世界とは別に電子世界が構築されている近未来。人々は電子世界にバーチャルの体（バーチャルフェイス）を持ち、現実世界の体（リアルフェイス）とバーチャルフェイスを使い分け、好む側の世界を生きるようになっていた。
電子世界における脅威『ウィルス』を狩る組織・ライエルツの一員のアヤは、あるとき単独任務を受けるのだが――それは彼女に秘められた秘密を暴くことになる。