トマスとマーガレットはともにロンドン塔に投獄された。同年7月18日、私権剥奪法により、議会は「前記の王位継承の妨害・邪魔・障害」を試みたとしてトマスの死刑を宣告した。同法はまた国王の許可を得ない如何なる王族の結婚も禁じた。トマスは刑の執行は免れたが、マーガレットが彼との関係を絶った後もロンドン塔に留め置かれた。彼は1537年10月31日にロンドン塔で死去した。マーガレットもまたロンドン塔で病に倒れ、ヘンリー8世は彼女を許し、女子修道院長の監督の下、サイオン修道院へ移した。1537年10月29日、彼女は監禁から解放された。