1402年から1403年にかけて起こった反乱とヴェンツェルの監禁の間、ゾフィーはフラデツ・クラーロヴェーに滞在した。ゾフィーは最初、ヤン・フスの支持者でフスの説教を聞いており、夫ヴェンツェル同様、フスに庇護を与えていた。しかし1410年にフスが教皇により破門されると、ゾフィーは支援をやめた。ゾフィーは1415年のフスの死により、反乱が起こると確信していた。