地球の人口が激減し、人類が異宙へと移住した世界。そこで平穏に暮らしていた乙女たちの生活が突如として狂い始める。彼女たちは正史から遠い枝葉世界で、水耕栽培により育てられていた。ある日、イネの友人であるムギが消えてしまう。噂ではムギは収穫され、食べられてしまったという。この衝撃的な出来事は、少女たちに自身の存在と生きる意味を問い直させる。彼女たちは「カンブリア爆発Ⅱ」という大量絶滅の余波に立ち向かい、逆境の未来に直面していく。ムギの消失の真実は一体何か。生存と決意の物語がここに幕を開ける。