中学三年生の緒川樹希は、学校内で執拗ないじめにあっていた。気の強い樹希はいじめなどものともしないが、クラス内で浮いていることが憂鬱だった。そんな樹希の前に現れた転校生戸鞠明良は、ドキドキするぐらい美少年なのに不愛想で、友達に成りたいクラスメートたちに近づくなオーラを発していた。

　美術の授業中にいじめの対象であることを無視して樹希に話しかけた明良は、早速いじめの首謀者である及川ありさに目を付けられ、放課後クラスの不良に絡まれるが、難なく撃退した。明良は八咫烏が棲む館の住人だったのだ。

　不思議な宿縁によって惹かれ合う樹希と明良、日本の歴史の裏に潜む皇援九家と呼ばれる謎の一族。やがて樹希は明良との関りを通じて、非日常的な戦いの世界に巻き込まれていくのだった。