2人は1男三女をもうけた。カルロス（1421ー1461）、ファナ（1423ー1425）、ブランカ（1424ー1464）レオノール（1426ー1479）で、1441年にブランカが死去した後、夫が単独のナバラ王となった。だが、ブランカが遺言で王位を長男カルロスに譲ると表明したにもかかわらず、フアンが王位を譲らなかったため、父子は対立し内戦が勃発した。