怪獣災害対策課は、50年間怪獣が一度も現れていないため、すっかり縮小された窓際組織だ。
隊員達は、怪獣オタクばかり。いつか本物の怪獣に出会うことを夢見ていた。

ある日、とある村に怪獣が出たと聞きつけ、喜び勇んで駆け付ける隊員達。
だが村長は、「怪獣を使って、村おこしをしたいので、退治しないで欲しい」と隊員達に懇願する。

情に厚く、怪獣愛も強い隊員達は、成り行きで村おこしを手伝うことになる。