大学生の中峰大樹は、サークル仲間である池辺翔吾・園崎梨夏・栞梛結依と、楽しくも充実した大学生活を送っていた。ところが、夏休みで実家に帰省した結依から〈大学に戻れないかもしれない〉という知らせが届く。
意を決して、結依の故郷であるＡ県の緋剣村を訪れた三人は、そこが“ヤマガミ様”にまつわる因習に支配された土地であることを知る。村人を襲う祟りや怪奇現象、神隠しで消える巡礼や旅人……そして、ついに事件が起きる。